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婴儿腹泻是由非感染和感染两类原因引起的。非感染性原因： 1）生理性腹泻，母乳的营养成分超过哭儿需要和消化功能的限度而使婴儿发生腹泻。 2）喂奶不当，如奶量增加太快、突然换奶（如人奶换成牛奶，牛奶换成样干粉等）、奶内加糖太多、喂奶时间变化太大以及增加辅食太快等。
3）物理因素刺激如婴儿腹部受凉、喂冷奶等。
4）消化道以外的全身性疾病如肺炎、感冒等也可以使小儿腹泻。有的疾病还会直接影响食物的吸收而造成腹泻。
感染性原因。
1）细菌感染主要是大肠杆菌和痢疾杆菌的感染。其原因很多，如牛奶污染、奶未经煮沸、奶具（如奶瓶、奶头）未能每次清洗煮烫、食用白糖污染以及吸吮手指等。夏季气候湿热，细菌容易繁殖，牛奶、水和奶具容易受到细菌污染，因此夏季发生细苗性腹泻机会比较多。同时，哭儿身体抵抗力不如儿童和成人，因此他们发生腹泻的机会要比儿童和成人多。
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